Pondok Pesantren Ar-Raudhah Yogyakarta pada awalnya berupa pengajian anak-anak yang dikelola diatas lahan Pribadi Prof. Dr.H. Ki.Supriyoko, M.Pd. sekaligus Beliau sebagai Badan Pendiri Yayasan Ndende KrisnawanYogyakarta. Kegiatan pendidikan itu dimulai pada tahun 1998, kemudian terjadi kefakuman sampai tahun 2005, sejak tahun 2005 mulai dirintis kembali oleh Prof. Dr.H. Ki.Supriyoko, M.Pd. atas permintaan tokoh masyarakat dan Pengurus Yayasan Ndende Krisnawan Yogyakarta pada waktu itu yang menyelenggarakan Lembaga pendidikan KB Insan Cendekia, TK Insan Cendekia, SMP Insan Cendekia, SMA Insan Cendekia, SMK Insan Cendekia ( 2 jurusan Administrasi Perkantoran Dan Otomotif ) Dan pada tahun 2005 awal meningkat menjadi Pondok Pesantren. Dan pada tahun itu pula Prof. Dr.H. Ki.Supriyoko, M.Pd. diserahi amanah yang cukup besar yaitu mengelola Program-program Yayasan dan Pondok Pesantren sekaligus menjadi Badan Pendiri Yayasan Ndende Krisnawan Yogyakarta. Pondok Pesantren Ar-Raudhah Yogyakarta merupakan satu-satunya Pondok Pesantren yang ada di Kecamatan Turi dan yang menyelenggarakan Pendidikan Wajardikdas 9 tahun. Pondok Pesantren ini dirintis oleh Prof. Dr.H. Ki.Supriyoko, M.Pd. Bpk Muchtadi, A.Ma ( yang menjadi Penasehat Pondok) Bpk Ir. Tarto sebagai Penyandang dana utama kegiatan Pondok ). Dukungan dari pihak Instansi Pemerintah : dari Lurah, Camat, Kepala KUA, Kakandepag Kab Sleman Yogyakarta dan Pemerintah Kota serta masih banyak lagi tokoh-tokoh masyarakat kab. Sleman yang memberikan dukungan terhadap pendirian Pondok Pesantren Ar-Raudhah Yogyakarta yang tidak dapat disebutkan satu-persatu. Pondok Pesantren Ar-Raudhah Yogyakarta terletak di di RT 03/ RW 27 Dusun Turi, Desa Donokerto, Kec. Turi, Kab.Sleman, D.I.Y Yogyakarta., sekitar 7 Km dari Kab. Sleman. lahan yang dimiliki seluas - + 750 M2.